Le CHU gère l’Institut de préparation aux carrières sanitaires et sociales, qui regroupe 10 écoles et instituts de formation. Il conduit par ailleurs des actions de formation continue pour les professionnels de santé du CHU et de la région Midi-Pyrénées.
Le CHU est par ailleurs partenaire des facultés de médecine, pharmacie et odontologie. A ce titre, il concourt à l’enseignement universitaire et post universitaire des praticiens hospitaliers et non hospitaliers.